Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SypQ62277 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SypQ62277 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SypQ62277 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SypQ62277 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SypQ62277 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SypQ62277 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SypQ62277 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SypQ62277 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SypQ62277 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms