Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpaQ62189 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms