Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms