Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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