Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms