Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

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Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vsx2Q61412 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vsx2Q61412 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vsx2Q61412 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vsx2Q61412 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsx2Q61412 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vsx2Q61412 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms