Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1eQ61290 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms