Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc6Q61143 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms