Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usf1Q61069 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usf1Q61069 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usf1Q61069 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usf1Q61069 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usf1Q61069 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usf1Q61069 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usf1Q61069 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usf1Q61069 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usf1Q61069 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usf1Q61069 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms