Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms