Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms