Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod1Q60867 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod1Q60867 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.2 ms