Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms