Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atf3Q60765 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms