Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms