Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms