Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms