Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms