Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Xrcc1Q60596 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Xrcc1Q60596 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Xrcc1Q60596 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Xrcc1Q60596 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Xrcc1Q60596 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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