Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms