Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brip1Q5SXJ3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms