Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LpoQ5SW46 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.8 ms