Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp18Q5SSI6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms