Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf215Q5SPX3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf215Q5SPX3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms