Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav8d-2Q5R1B6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms