Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv4Q5R1A3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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