Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RilpQ5ND29 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms