Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp36l3Q5ISE2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l3Q5ISE2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms