Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp28Q5I043 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Usp28Q5I043 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Usp28Q5I043 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Usp28Q5I043 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Usp28Q5I043 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp28Q5I043 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms