Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ecm2Q5FW85 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms