Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms