Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp22Q5DU02 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms