Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufaf2Q59J78 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms