Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpjQ569L8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms