Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms