Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms