Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc84Q4VA36 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms