Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Xirp2Q4U4S6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xirp2Q4U4S6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms