Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms