Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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