Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk4Q3V129 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms