Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms