Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b4Q3V0X2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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