Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd53Q3V0J4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms