Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms