Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3V0E1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3V0E1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms