Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttc9Q3V038 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc9Q3V038 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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