Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrfip1Q3UZ39 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms