Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms