Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms